1.生物信息百Jia软件(二):fastp
2.期货软件TB系统源代码解读系列36-R-Breaker系统
3.Python和Django的过滤过滤基于协同过滤算法的**推荐系统源码及使用手册
4.Wireshark介绍、Wireshark使用教程
生物信息百Jia软件(二):fastp
欢迎关注基因学苑公众号,我们深入生物信息领域的源码源码系列文章继续展开。今天,过滤过滤我们将探讨《生物信息百佳软件》系列中的软件软件明星——fastp。百佳,源码源码asp源码大气意指众多优秀工具中的过滤过滤精选,掌握这些软件,软件软件可以大大提升数据分析能力。源码源码
fastp,过滤过滤由陈实富团队于深圳海普洛斯公司开发并开源,软件软件其在数据质控过滤方面表现出色。源码源码这款工具不仅能一次处理测序数据,过滤过滤过滤低质量、软件软件去除adapter、源码源码切割reads,还能处理长读数据,如Pacbio和Iontorrent的数据。亮点在于,它能直接生成质控和统计报告,包括json和html格式,且基于c++编写,效率极高。
下载安装方式有两种:一是通过git克隆源代码,然后编译安装;二是直接下载编译好的版本。软件使用时,参数众多,如指定输入和输出文件、繁星直播源码质量体系、压缩格式,以及各种质量控制选项,如过滤低质量的Q值、碱基占比、N碱基数量和长度等。此外,还有报告格式选项,如输出json和html报告,以及split选项用于处理大文件。
实例演示如下:fastp命令 "-i reads.1.fq.gz -I reads.2.fq.gz -o clean.1.fq.gz -O clean.2.fq.gz -z 4 -q -u -n -h clean.html",用于对读取文件进行预处理并生成HTML报告。
通过fastp,你可以高效地对序列数据进行前期处理,为后续的生物信息分析打下坚实基础。现在,让我们开始你的生物信息软件学习之旅吧!
期货软件TB系统源代码解读系列-R-Breaker系统
R-Breaker系统是一种基于昨日价格的交易参考工具,它简化了Pivot Points,仅去除了一个枢轴点,交易策略基础是突破上界做多,下界做空。若做多后回撤至次上界,认为是假突破,应反手操作。以下是系统的核心代码和部分解释:参数设置:如notbef(9.)代表时间需大于0.,Notaft(.)表示时间需小于0.,源码weblogic视频其余参数如f1、f2、f3、reverse、rangemin和xdiv等用于计算关键价位。
变量声明:包括数值序列变量如ssetup、bsetup等,用于存储计算结果,以及布尔型变量rfilter,用于过滤操作。
代码执行逻辑:根据日期变化,计算当日开盘价的倍数作为参考区间。在特定时间范围内,如9点到2点分,根据市场波动判断是否突破区间进行买卖操作,同时考虑持仓状态和个人设置的条件。
警告:作者并未实际在实盘或超级图表上测试过此系统,认为在使用前需要根据个人市场分析和策略调整优化。
总的来说,R-Breaker系统是一个动态计算买卖点的工具,需要交易者根据市场状况灵活运用,并可能需要结合其他指标或个人判断进行调整。Python和Django的基于协同过滤算法的**推荐系统源码及使用手册
软件及版本
以下为开发相关的技术和软件版本:
服务端:Python 3.9
Web框架:Django 4
数据库:Sqlite / Mysql
开发工具IDE:Pycharm
**推荐系统算法的实现过程
本系统采用用户的历史评分数据与**之间的相似度实现推荐算法。
具体来说,这是基于协同过滤(Collaborative Filtering)的一种方法,具体使用的是基于项目的协同过滤。
以下是平台系统源码系统推荐算法的实现步骤:
1. 数据准备:首先,从数据库中获取所有用户的评分数据,存储在Myrating模型中,包含用户ID、**ID和评分。使用pandas库将这些数据转换为DataFrame。
2. 构建评分矩阵:使用用户的评分数据构建评分矩阵,行代表用户,列代表**,矩阵中的元素表示用户对**的评分。
3. 计算**相似度:计算**之间的相似度矩阵,通常通过皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient)来衡量。
4. 处理新用户:对于新用户,推荐一个默认**(ID为的**),创建初始评分记录。
5. 生成推荐列表:计算其他用户的评分与当前用户的评分之间的相似度,使用这些相似度加权其他用户的评分,预测当前用户可能对未观看**的评分。
6. 选择推荐**:从推荐列表中选择前部**作为推荐结果。
7. 渲染推荐结果:将推荐的**列表传递给模板,并渲染成HTML页面展示给用户。
系统功能模块
主页**列表、**详情、**评分、**收藏、**推荐、注册、登录
项目文件结构核心功能代码
显示**详情评分及收藏功能视图、java测试源码根据用户评分获取相似**、推荐**视图函数
系统源码及运行手册
下载并解压源文件后,使用Pycharm打开文件夹movie_recommender。
在Pycharm中,按照以下步骤运行系统:
1. 创建虚拟环境:在Pycharm的Terminal终端输入命令:python -m venv venv
2. 进入虚拟环境:在Pycharm的Terminal终端输入命令:venv\Scripts\activate.bat
3. 安装必须依赖包:在终端输入命令:pip install -r requirements.txt -i /simple
4. 运行程序:直接运行程序(连接sqllite数据库)或连接MySQL。
Wireshark介绍、Wireshark使用教程
一、简介:Wireshark(前称 Ethereal)是一个网络封包分析软件。网络封包分析软件的功能是撷取网络封包,并尽可能显示出最为详细的网络封包资料。Wireshark 使用 WinPCAP 作为接口,直接与网卡进行数据报文交换。
网络封包分析软件的功能可想像成 电工技师使用电表来量测电流、电压、电阻 的工作 - 只是将场景移植到网络上,并将电线替换成网络线。在过去,网络封包分析软件是非常昂贵的,或是专门属于营利用的软件。Ethereal 的出现改变了这一切。在 GNUGPL 通用许可证的保障范围底下,使用者可以以免费的代价取得软件与其源代码,并拥有针对其源代码修改及客制化的权利。Ethereal 是目前全世界最广泛的网络封包分析软件之一。
网络管理员使用 Wireshark 来检测网络问题,网络安全工程师使用 Wireshark 来检查资讯安全相关问题,开发者使用Wireshark 来为新的通讯协定除错,普通使用者使用 Wireshark 来学习网络协定的相关知识。当然,有的人也会居心叵测的用它来寻找一些敏感信息
Wireshark 不是入侵侦测系统(Intrusion Detection System,IDS)。对于网络上的异常流量行为,Wireshark 不会产生警示或是任何提示。然而,仔细分析 Wireshark 撷取的封包能够帮助使用者对于网络行为有更清楚的了解。Wireshark 不会对网络封包产生内容的修改,它只会反映出目前流通的封包资讯。 Wireshark 本身也不会送出封包至网络上。
wireshark 能获取 HTTP,也能获取 HTTPS,但是不能解密 HTTPS,所以 wireshark 看不懂 HTTPS 中的内容,如果是处理 HTTP,HTTPS 还是用 Fiddler,其他协议比如 TCP,UDP 就用 wireshark。同类产品:tcpview
二、工作流程:
(1)确定 Wireshark 的位置。如果没有一个正确的位置,启动 Wireshark 后会花费很长的时间捕获一些与自己无关的数据。
(2)选择捕获接口。一般都是选择连接到 Internet 网络的接口,这样才可以捕获到与网络相关的数据。否则,捕获到的其它数据对自己也没有任何帮助。
(3)使用捕获过滤器。通过设置捕获过滤器,可以避免产生过大的捕获文件。这样用户在分析数据时,也不会受其它数据干扰。而且,还可以为用户节约大量的时间。
(4)使用显示过滤器。通常使用捕获过滤器过滤后的数据,往往还是很复杂。为了使过滤的数据包再更细致,此时使用显示过滤器进行过滤。
(5)使用着色规则。通常使用显示过滤器过滤后的数据,都是有用的数据包。如果想更加突出的显示某个会话,可以使用着色规则高亮显示。
(6)构建图表。如果想要更明显的看出一个网络中数据的变化情况,使用图表的形式可以很方便的展现数据分布情况。
(7)重组数据。Wireshark 的重组功能,可以重组一个会话中不同数据包的信息,或者是一个重组一个完整的或文件。由于传输的文件往往较大,所以信息分布在多个数据包中。为了能够查看到整个或文件,这时候就需要使用重组数据的方法来实现。
三、使用教程:
1、英文版界面菜单及布局:
2、捕捉过滤器:
捕捉过滤器的语法与其它使用Lipcap(Linux)或者Winpcap(Windows)库开发的软件一样,比如著名的TCPdump。捕捉过滤器必须在开始捕捉前设置完毕,这一点跟显示过滤器是不同的。
设置捕捉过滤器的步骤是:
- 选择 capture - options。
- 填写capture filter栏或者点击capture filter按钮为您的过滤器起一个名字并保存,以便在今后的捕捉中继续使用这个过滤器。
- 点击开始(Start)进行捕捉。
语法:Protocol Direction Host(s) Value Logical Operations Other expression
例子:tcp dst .1.1.1 and tcp dst .2.2.2
Protocol(协议):
可能的值: ether, fddi, ip, arp, rarp, decnet, lat, sca, moprc, mopdl, tcp and udp.
如果没有特别指明是什么协议,则默认使用所有支持的协议。
Direction(方向):
可能的值: src, dst, src and dst, src or dst
如果没有特别指明来源或目的地,则默认使用 src or dst 作为关键字。
例如,host .2.2.2与src or dst host .2.2.2是一样的。
Host(s):
可能的值: net, port, host, portrange.
如果没有指定此值,则默认使用host关键字。
例如,src .1.1.1与src host .1.1.1相同。
Logical Operations(逻辑运算):
可能的值:not, and, or.
否(not)具有最高的优先级。或(or)和与(and)具有相同的优先级,运算时从左至右进行。例如,
not tcp port and tcp port 与(not tcp port ) and tcp port 相同。
not tcp port and tcp port 与not (tcp port and tcp port )不同。
例子:
tcp dst port 显示目的TCP端口为的封包。
ip src host .1.1.1 显示来源IP地址为.1.1.1的封包。
host .1.2.3 显示目的或来源IP地址为.1.2.3的封包。
src portrange - 显示来源为UDP或TCP,并且端口号在至范围内的封包。
not imcp 显示除了icmp以外的所有封包。(icmp通常被ping工具使用)
src host .7.2. and not dst net ..0.0/ 显示来源IP地址为.7.2.,但目的地不是..0.0/的封包。
(src host .4.1. or src net .6.0.0/) and tcp dst portrange - and dst net .0.0.0/8 显示来源IP为.4.1.或者来源网络为.6.0.0/,目的地TCP端口号在至之间,并且目的位于网络.0.0.0/8内的所有封包。
注意事项:
当使用关键字作为值时,需使用反斜杠\。
ether proto \ip (与关键字ip相同).
这样写将会以IP协议作为目标。
ip proto \icmp (与关键字icmp相同).
这样写将会以ping工具常用的icmp作为目标。
可以在ip或ether后面使用multicast及broadcast关键字。
当您想排除广播请求时,no broadcast就会非常有用。
3、显示过滤器:
通常经过捕捉过滤器过滤后的数据还是很复杂。此时您可以使用显示过滤器进行更加细致的查找。
它的功能比捕捉过滤器更为强大,而且在您想修改过滤器条件时,并不需要重新捕捉一次。
语法:Protocol String 1 String 2 Comparison operator Value Logical Operations Other expression
例子:ftp passive ip == .2.3.4 xor icmp.type
Protocol(协议):
您可以使用大量位于OSI模型第2至7层的协议。点击Expression...按钮后,您可以看到它们。
比如:IP,TCP,DNS,SSH
Wireshark的网站提供了对各种 协议以及它们子类的说明。
四、练习:
首次启动:本案例的客户端有 4 块网卡,其中出口网卡被命名为 ,使用 Wireshark 版本是 v2.0.1
双击 出口网卡 ,开始捕捉包。或者从菜单开始此步,注意勾选混杂模式:
正在对 网卡 进行捕包:
滚屏设置:
封包列表(Packet List Pane)的面板中显示:编号,时间戳,源地址,目标地址,协议,长度,以及封包信息。
不同的协议用了不同的颜色显示,也可以修改这些显示颜色的规则, View -Coloring Rules
保存后的本地文件:
查看 arp 协议的数据包:
查看与某个地址相关的握手: